Niektóre bakterie są człowiekowi niezbędne (np. flora przewodu pokarmowego czy pochwy).
Wiele potencjalnie groźnych bakterii wykrywa się u ludzi zdrowych. Mówimy wtedy o tak zwanym nosicielstwie. Gdy spadnie odporność organizmu, te czyhające bakterie mogą wywołać infekcję.
U dzieci choroby bakteryjne wywołują najczęściej:
paciorkowce - anginę, zapalenie płuc i opon mózgowo-rdzeniowych;
gronkowce - zakażenie skóry, zapalenie płuc, zapalenie kości;
pałeczki (salmonella, escherichia coli) - biegunkę, infekcje układu moczowego.
Toksyny produkowane przez bakterie wywołują u chorego dziecka wysoką gorączkę. Zakażenia bakteryjne leczy się antybiotykami. Ponieważ nie wszystkie bakterie są wrażliwe na te same antybiotyki, przed podaniem leku dobrze jest wykonać tzw. posiew. W zależności od miejsca zakażenia pobiera się krew, mocz lub wymaz z gardła, żeby sprawdzić, jaka bakteria wywołała chorobę i na jakie leki jest wrażliwa. Bakterie coraz lepiej bronią się przed antybiotykami i dlatego muszą powstawać wciąż nowe odmiany leków.